Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LctF8VPT3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms