Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5160F8VPN3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5160F8VPN3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms