Protein–RNA interactions for Protein: F7CD45

Gm8334, Predicted gene 8334, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8334F7CD45 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8334F7CD45 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms