Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28038F7BCN9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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