Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Crocc2F6XLV1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms