Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Atf6F6VAN0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atf6F6VAN0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms