Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Syngap1F6SEU4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms