Protein–RNA interactions for Protein: F2Z403

Defa27, Defensin, alpha, 27, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa27F2Z403 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa27F2Z403 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms