Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms