Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc146E9Q9F7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc146E9Q9F7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms