Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8N6

Aknad1, AKNA domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aknad1E9Q8N6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aknad1E9Q8N6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aknad1E9Q8N6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Aknad1E9Q8N6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Aknad1E9Q8N6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Aknad1E9Q8N6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Aknad1E9Q8N6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Aknad1E9Q8N6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms