Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6W0

BC030500, cDNA sequence BC030500 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030500E9Q6W0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC030500E9Q6W0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms