Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BC051665E9Q623 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms