Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms