Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip11E9Q512 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms