Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms