Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd1E9PZ26 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms