Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc8E9PWG2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms