Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms