Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30bE9PVL6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms