Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc17E9PVB5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms