Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc175E9PVB3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms