Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syde2E9PUP1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syde2E9PUP1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms