Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Soga1E1U8D0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga1E1U8D0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms