Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb3D3Z6J4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms