Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cttnbp2B9EJA2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cttnbp2B9EJA2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms