Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ppfia1B2RXQ2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms