Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms