Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cfap58B2RW38 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cfap58B2RW38 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms