Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms