Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Apol7aB2RT54 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms