Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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Zbed5B2RPU8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed5B2RPU8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms