Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trabd2bB1ATG9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms