Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms