Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3173A6NAS3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms