Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll11A4Q9F4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll11A4Q9F4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms