Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms