Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al1jA2BFR3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al1jA2BFR3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al1jA2BFR3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al1jA2BFR3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al1jA2BFR3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al1jA2BFR3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2al1jA2BFR3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2al1jA2BFR3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2al1jA2BFR3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2al1jA2BFR3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2al1jA2BFR3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2al1jA2BFR3 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2al1jA2BFR3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2al1jA2BFR3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2al1jA2BFR3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2al1jA2BFR3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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