Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Samt1A2BED8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Samt1A2BED8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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