Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl41A2AUC9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms