Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syndig1A2ANU3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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