Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms