Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms