Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itgb4A2A863 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb4A2A863 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms