Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt6bQ9Z331 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms