Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Krt27Q9Z320 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt27Q9Z320 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Krt27Q9Z320 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Krt27Q9Z320 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Krt27Q9Z320 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Krt27Q9Z320 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Krt27Q9Z320 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt27Q9Z320 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms