Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Homer1Q9Z2Y3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Homer1Q9Z2Y3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Homer1Q9Z2Y3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Homer1Q9Z2Y3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Homer1Q9Z2Y3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Homer1Q9Z2Y3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Homer1Q9Z2Y3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Homer1Q9Z2Y3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Homer1Q9Z2Y3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Homer1Q9Z2Y3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Homer1Q9Z2Y3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Homer1Q9Z2Y3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Homer1Q9Z2Y3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.1 ms