Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Mrpl40Q9Z2Q5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Mrpl40Q9Z2Q5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Mrpl40Q9Z2Q5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Mrpl40Q9Z2Q5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Mrpl40Q9Z2Q5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Mrpl40Q9Z2Q5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Mrpl40Q9Z2Q5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Mrpl40Q9Z2Q5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms