Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crlf3Q9Z2L7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crlf3Q9Z2L7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms