Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms